Madrasah Ibtidaiyah Negeri (MIN) 3 Pontianak merupakan salah satu lembaga pendidikan dasar Islam negeri di Kota Pontianak, Kalimantan Barat. Madrasah ini berada di Jalan Parit H. Husin I, Kelurahan Bangka Belitung Laut, Kecamatan Pontianak Tenggara.
Pada awalnya, madrasah ibtidaiyah ini direncanakan berdiri karena melihat situasi serta perkembangan saat itu akan kebutuhan hadirnya lembaga pendidikan Agama Islam yang sangat pesat di Kota Pontianak, Provinsi Kalimantan Barat. Maka pada akhirnya Kementerian Agama Republik Indonesia memutuskan untuk mendirikan Madrasah Ibtidaiyah Negeri yang baru di Kota Pontianak, Provinsi Kalimantan Barat. Status ini juga diperkuat dengan adanya SK Pendirian dan Penegerian berdasarkan Keputusan Menteri Agama Nomor 555 Tahun 2000 tanggal 16 Februari 2000 sebagai dasar hukum pendirian MIN Bangka Belitung Kota Pontianak pada saat itu. Pada akhirnya, Madrasah Ibtidaiyah Negeri ini diresmikan pada tanggal 16 Februari 2004 oleh Walikota Pontianak saat itu, Bapak dr. H. Buchari Abdurrachman.
Dalam perkembangannya, madrasah yang dahulu dikenal dengan sebutan MIN BABEL ini terus bertransformasi dan berkembang dalam memberikan layanan pendidikan dasar yang berlandaskan nilai-nilai keislaman. Madrasah ini telah menjadi salah satu pilihan favorit masyarakat Kota Pontianak, dan sekitarnya. Perkembangan ini tidak lepas dari dukungan berbagai pihak, komitmen guru dan tenaga kependidikan, serta kepercayaan orang tua/wali murid.
Kemudian Pada Tahun 2014-2015, Sejarah madrasah ini kembali tercatat dengan perubahan dari sisi administrasi dan branding madrasah, melalui SK Penataan Nomenklatur berdasarkan Keputusan Menteri Agama Nomor 157 Tahun 2014 tanggal 17 September 2014 yang mengubah nama administrasi dari MIN Bangka Belitung resmi menjadi MIN 3 Pontianak agar tertib administrasi penomoran di tingkat kota.
Secara administrasi, MIN 3 Pontianak tercatat sebagai satuan pendidikan negeri dengan NPSN 60722624 dan memiliki SK Operasional berdasarkan Keputusan Menteri Agama Nomor 678 Tahun 2016 tanggal 17 November 2016. Madrasah ini juga telah memperoleh akreditasi A.
Dari generasi ke generasi, MIN 3 Pontianak telah melahirkan ribuan alumni yang berakhlak mulia dan berprestasi. Semangat “MIN 3 Pontianak, Berprestasi, Terdepan, Berakhlak Mulia” yang terus digaungkan saat ini menjadi pendorong bagi seluruh ekosistem di MIN 3 Pontianak untuk terus meningkatkan kualitas dan prestasi di tingkat daerah serta nasional maupun internasional.
Seiring perjalanan waktu, MIN 3 Pontianak terus berkomitmen meningkatkan mutu pendidikan melalui penguatan ilmu pengetahuan, teknologi, pembentukan karakter, serta pembiasaan nilai-nilai akhlak Islami. Dengan semangat tersebut, MIN 3 Pontianak berupaya menjadi madrasah yang mampu mencetak generasi yang berakhlak mulia, cerdas, terampil, dan berprestasi
